As principais zonas de uma extrusora são o bloco de aquecimento e a zona de dissipação, embora estas estão formadas à sua vez por várias partes. Para entender o funcionamento básico do processo de extrusão dos filamentos nas impressoras 3D, é fundamental compreender a funcionalidade de ambas zonas. O filamento entra em primeiro lugar pela zona fria do extrusor (zona de dissipação térmica), a seguir passa pelo hotend, reblandece e acaba saindo pela boquilha ou nozzle voltando-se a endurecer.

A zona de dissipação é muito importante no extrusor já que nela se dissipa o calor do filamento proveniente da zona de aquecimento. No caso de que nessa zona não se dissipasse corretamente o calor, aquecer-se-ia o filamento reblandeciéndose demasiado e impedindo o correto avanço do mesmo ao longo da zona de dissipação do extrusor (devido à dilatación e à perda de consistência), o que acabaria gerando uma bola de plástico que provocaria um atasco no  interior da extrusora. Deve-se ter em conta que normalmente a zona mais conflictiva é onde se unem ambas zonas, ao final do cano de teflón PTFE. Para favorecer o enfriamiento na zona de dissipação de calor costuma-se acoplar um ou dois ventiladores no extrusor.

Outro tema importante a ter em conta face ao bom cuidado do extrusor da impressora 3D é o imprimir os filamentos às temperaturas corretas, já que no caso de imprimir a pouca temperatura o filamento poderia atascarse no interior do extrusor obstruyendo o passo do mesmo, e em caso de imprimir a uma temperatura elevada poder-se-iam carbonizar diminutas partículas de plástico no interior do extrusor provocando uma obstrução parcial do interior do extrusor. Estas partículas duras e carbonizadas nunca poderão ser extruidas pelo extrusor pelo que a única alternativa é utilizar um filamento de limpeza especificamente desenhado para ter a viscosidade e estabilidade térmica adequada para poder arrastar todas estas partículas deixando totalmente limpo o interior do extrusor.

A importância de garantir um fluxo suave e contínuo do filamento no extrusor, além de prolongar a própria vida do extrusor também garantirá uma melhor qualidade de impressão.